Investigação das dinâmicas populacionais em golfinhos nariz-de-garrafa offshore (Tursiops truncatus) : implicações para conservação de uma pequena população em um remoto arquipélago

Abstract

The common bottlenose dolphin, Tursiops truncatus, is differentiated into two ecotypes: offshore and inshore. The classification is based on genetics, distribution, morphology, diversity, and behavior. Although T. truncatus is a widely studied species, few studies focused on offshore populations. Offshore biodiversity is often overlooked due to data collection challenges, making it difficult to assess the extent of the threat facing these populations. In this context, a small population of dolphins residing around the Saint Peter Saint Paul Archipelago (SPSPA) in the middle of the Atlantic Ocean has been monitored for approximately 20 years, and recently, a decrease in the sightings of these animals has been observed. To infer the conservation status and to better understand the relationships between the SPSPA population and other offshore populations, we employed two approaches: (1) we analyzed the most comprehensive dataset of mitochondrial DNA control region available for this species, sourced from databases. (2) analyzing sequence data using the double digestion restriction site-associated DNA (ddRAD) technique to compare different populations of the offshore ecotype. The analyses aim to evaluate the genetic diversity and population structure of the offshore bottlenose dolphin populations in the Atlantic Ocean. The results of this thesis suggest that there is no distinction between offshore and inshore haplotypes in the Atlantic Ocean, and that the ASPSP population exhibits lower genetic diversity and greater differentiation compared to other offshore populations. Offshore populations typically present low population structure and gene flow even over long distances, which maintains high genetic diversity, they can also present a variety of diverse and complex behaviors that cause population structuring, as is the case with the ASPSP population. Thus, this thesis contributes to improving our understanding of the population dynamics of the offshore ecotype, to provide support for correct management measures for these populations, especially the small ASPSP population.

O golfinho nariz-de-garrafa comum, Tursiops truncatus, é diferenciado em dois ecótipos: offshore e inshore. Embora T. truncatus seja uma espécie amplamente estudada, poucos estudos focaram em populações offshore. A biodiversidade offshore é frequentemente negligenciada devido a dificuldade de coleta de dados e, portanto, é difícil avaliar até que ponto estas populações estão ameaçadas. Uma pequena população de golfinhos que reside ao redor do Arquipélago de São Pedro e São Paulo (ASPSP), no meio do Oceano Atlântico, tem sido monitorada há aproximadamente 20 anos, tendo-se notado recentemente uma diminuição nos avistamentos destes animais. Para inferir o estado de conservação e compreender melhor as relações entre a população ASPSP e outras populações offshore, utilizamos duas abordagens: (1) analisamos o mais abrangente conjunto de dados da regido controle do DNA mitocondrial, através de bancos de dados, para esta espécie; (2) analisamos dados de sequência utilizando a técnica de Double digestion restriction site-associated DNA (ddRAD) para comparar diferentes populações do ecótipo offshore. As análises empregadas têm o objetivo de avaliar a diversidade genética e a estrutura populacional do golfinho-nariz-de-garrafa de populações no Oceano Atlântico. Os resultados desta tese sugerem que não há uma divisão entre haplótipos offshore e inshore no Oceano Atlântico, além disso, a população de ASPSP possui menor diversidade genética e maior diferenciação comparada a outras populações offshore. As populações offshore normalmente apresentam baixa estrutura populacional e fluxo gênico mesmo em longas distâncias, o que mantém uma alta diversidade genética, contudo, também podem apresentar uma variedade de comportamentos diversos e complexos que causam estruturação populacional, como é o caso da população ASPSP. Assim, esta tese contribui para melhorar nossa compreensão sobre as dinâmicas populacionais do ecótipo offshore, com o intuito de fornecer suporte para medidas de manejo corretas sob estas populações, em especial a pequena população de ASPSP.