Determinação do limite mínimo de detecção da técnica de Nested-PCR para os poliomavírus JC e BK
dc.contributor.author | Vieira, Aline dos Santos | pt_BR |
dc.contributor.author | Machado, Alice Beatriz Mombach Pinheiro | pt_BR |
dc.contributor.author | Coitinho, Adriana Simon | pt_BR |
dc.contributor.author | Paris, Fernanda de | pt_BR |
dc.date.accessioned | 2017-05-23T02:26:26Z | pt_BR |
dc.date.issued | 2014 | pt_BR |
dc.identifier.issn | 2357-9730 | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10183/158323 | pt_BR |
dc.description.abstract | Introdução: Os poliomavírus (JCV e BKV) causam infecções principalmente em adultos imunocomprometidos. Um diagnóstico sensível e específico é de fundamental importância para os pacientes portadores de JCV e BKV. Atualmente alguns laboratórios têm utilizado a técnica de PCR para a detecção do material genético destes vírus em amostras clínicas. Assim, o objetivo deste estudo é determinar o limite mínimo de detecção da técnica de nested-PCR para os poliomavírus JC e BK. Métodos: Diluições seriadas (100 cópias/mL; 50 cópias/mL; 25 cópias/mL; 10 cópias/mL; 5 cópias/mL e 1 cópia/mL) de controles positivos comerciais de JCV e BKV com concentrações conhecidas foram submetidas à técnica de nested-PCR semi-duplex. Todas as diluições foram testadas 11 vezes para determinação do limite mínimo de detecção. Resultados: O limite mínimo de detecção da reação de nested-PCR para os vírus JC e BK foi de 25 cópias/mL para ambos, com 100% de positividade das diluições testadas na reação de PCR. Ainda, pudemos observar que resultados positivos fracos foram obtidos nas diluições de 1, 5 e 10 cópias/mL em algumas das repetições realizadas. As diluições de 25, 50 e 100 cópias/mL sempre obtiveram resultado francamente positivo. Conclusões: Estes valores são semelhantes aos relatados em outros estudos, contribuindo para a indicação desta reação de PCR para potenciais fins diagnósticos. | pt |
dc.description.abstract | Introduction: Polyomaviruses (BKV and JCV) cause infection mainly in immunocompromised adults. A sensitive and specific diagnosis tool is fundamental to demonstrate the BKV and JCV infections. Nowadays many laboratories are using a PCR technique for detecting polyomaviruses genome in clinical samples. In this context, the purpose of this study is to determine the threshold of detection of the nested-PCR for polyomaviruses JC and BK. Methods: Serial dilutions of the samples of BKV and JCV of known concentration (100 copies/mL, 50 copies/mL, 25 copies/mL, 10 copies/mL, 5 copies/mL, and 1 copy/ml) were subjected to the technique of nested-PCR. All dilutions were tested 11 times to determine the minimum detection limit. Results: The minimum detection limit of the nested-PCR for JC and BK viruses was 25 copies/mL. This dilution (25 copies/mL) showed 100% PCR positive reaction. Furthermore, we found that weak positive results were obtained at dilutions of 1,5 and 10 copies/mL in some repetitions. Dilutions of 25, 50, and 100 copies/mL always had very positive results. Conclusions: These values are similar to those reported in other studies, contributing to the indication of this PCR for potential diagnostic purposes. | en |
dc.format.mimetype | application/pdf | pt_BR |
dc.language.iso | por | pt_BR |
dc.relation.ispartof | Clinical and biomedical research. Porto Alegre. Vol. 34, n. 3 (jul./set. 2014), p. 260-265 | pt_BR |
dc.rights | Open Access | en |
dc.subject | Polyomavirus | pt_BR |
dc.subject | JCV | en |
dc.subject | BKV | en |
dc.subject | Vírus JC | pt_BR |
dc.subject | Nested-PCR | en |
dc.subject | Reação em cadeia da polimerase | pt_BR |
dc.subject | Limite de detecção | pt_BR |
dc.subject | Minimum detection limit | en |
dc.subject | Viroses | pt_BR |
dc.title | Determinação do limite mínimo de detecção da técnica de Nested-PCR para os poliomavírus JC e BK | pt_BR |
dc.title.alternative | Assessment of minimum detection limit of Nested-PCR for JC and BK polyomaviruses | en |
dc.type | Artigo de periódico | pt_BR |
dc.identifier.nrb | 000946550 | pt_BR |
dc.type.origin | Nacional | pt_BR |
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